紫草性寒，有清熱涼血、解毒、透疹之功，故對血熱毒盛，麻疹、斑疹透發不暢等症，可與蟬衣、牛蒡子、連翹、荊芥等配伍應用;如疹出而色甚深，呈紫暗色而不紅活者，這也是血熱毒盛的症候，須以涼血解毒藥如丹皮、赤芍、銀花、連竅等同用。此外，試用紫草預防麻疹，可減輕麻疹症狀或減少麻疹發病率。
1、治療急慢性肝炎：用從紫草根中提取的紫草紅(素)乾燥粉末爲熔質，以氫氧化鈉溶液爲溶劑，製成0、2%紫草注射液。肌肉注射，每日-2次，每次ml。
2、治療肺結核合併血小板減少性紫癜：曾報告1例，經一般中西綜合治療效果不顯，改用大量紫草後獲得效果。第1日用1兩，服後鼻衄即減;第2日加至2兩，鼻衄完全停止;連用5劑，血小板計數增至170000/mm3，全身紫斑消退，病情轉危爲安。服藥後有腹瀉反應，但患者並無不適感。
3、治療惡性葡萄胎併發子宮絨毛膜上皮癌：曾報告1例，手術後X線攝片發現肺部有轉移病竈，經1個月觀察，轉移病竈漸見擴大，臨牀症狀也日見加重。採用紫草根1兩，每日煎服1劑，10天爲一療程。經四個療程，臨牀症狀大爲減輕，X線複查病竈大部分消失。繼續服紫草根1個月，臨牀症狀全部消失，小便妊娠反應陰性。
4、治療嬰兒皮炎、外陰溼疹、陰道炎及子宮頸炎：採用2%、10%、20%、40%紫草菜油浸劑，或用紫草乙醚提出物配成1%菜油製劑，局部應用。
①試治嬰兒臀部皮炎100例，用藥後無1例發生糜爛情況。
②婦女尿生殖瘻病人，因經常漏尿而造成陰部的溼疹、糜爛、潰瘍以及各種原因所致的陰道溢液加多，塗紫草油後3-5天左右即可見效。曾治療28例，痊癒24例。
③用於陰道炎，一般在塗藥後4-6天可以治癒，而且複發率很低。曾治療234例，治癒率77、7%。
④子宮頸炎如並有盆腔炎或重度糜爛、充血，並有膿性分泌物者，易引起流血、感染及盆腔炎急性發作，可採用紫草油塗抹。根據病情輕重，連續1-3周，可使充血及膿性分泌物消失，直至痊癒。治療182例，痊癒96例。紫草油的濃度愈高，效果愈好，增加濃度並無任何副作用。紫草油似無抑菌作用，其臨牀療效的原理，需進一步研究。
5、治療青年扁平疣及銀屑病：用紫草的提取物紫草醌製成0、1%注射液，肌肉注射每次ml;少數銀屑病患者用0、05%紫草醌注射液行靜脈注射，每次ml。均每日1次。青年扁平疣23例，經治7-10次後，痊癒(自覺症狀消失，皮疹全部或絕大部分消退)10例，效(症狀減輕，皮疹明顯變小變平或紅斑變淡，鱗屑變薄)10例，無效(注射10次以上皮疹未見改善)3例。銀屑病肌注治療29例，經10-20次治後，治癒5例，顯效15例，無效9例;靜注治療7例，經10次後治癒3例，顯效1例，無效3例。初步觀察，對扁平疣效果確實，療程明顯縮短，且複發率低。而銀屑病以進行期病變療效較好。缺點爲注射局部疼痛。另曾有用紫草根20g加二甲基亞碸100ml，浸泡3-4天后取藥液塗抹局部，每天1-2次;治療扁平疣20餘例，一般經1-2周即見扁平疣脫落或平復。
6、治療玫瑰糠疹：用紫草0、5-1兩(小兒2-5錢)，每日煎服1劑，10日爲一療程。經一定間歇後可繼續服用幾個療程。治療70例，痊癒37例，進步25例，無效8例。平均服藥9天，多不超過2個月。
7、關於預防麻疹：紫草根預防麻疹，各地曾廣泛試用，但用法不盡相同，效果亦很不一致。
8、用紫草根煎劑、丸劑及複方紫草根煎劑(紫草根、白朮、木香)3種劑型口服。