碧璽和水晶的區別主要觀察它們的顏色，一般來說水晶中紫色比較少見，碧璽的紫色一般較淺，有粉紫和淺紫，反觀水晶卻沒有像碧璽一樣的紅色和綠色(除毛髮晶除外)，因而可以利用這兩者之間顏色不同來大致鑑定真假，下面我們就一起來看一看碧璽和水晶的區別吧!
成分不同
碧璽和水晶的化學成分不同。碧璽是一種硅酸鹽，具體成分相當複雜，因此還沒有出現合成碧璽。而水晶是一種大型石英結晶體礦物，其主要由二氧化硅構成，因而合成水晶十分容易。此外，水晶的衍生物也相當多，當二氧化硅完美結晶時形成水晶，二氧化硅膠化脫水後則成爲瑪瑙，二氧化硅含水的膠體凝固後就成了蛋白石，二氧化硅晶粒小於幾微米時，就組成玉髓、燧石、次生石英岩。
電性不同
碧璽受熱具有壓電性和熱電性，在碧璽受熱時其表面會釋放電荷，這些電荷可以吸引空氣中的灰塵和紙屑，這是瑞典科學家林內斯在1768年發現的，因而其礦物學名稱爲“電氣石”，而水晶則不具有這種效應。
顏色不同
碧璽的顏色經細分多達15種複色之多，因爲可碧璽含有鋁、鐵、鎂、鈉、鋰、鉀等元素，正是由於這些化學元素使得碧璽可呈現各式各樣的顏色。而水晶主要化學成份是二氧化硅，，純淨時形成無色透明的晶體，當含微量元素Al、Fe等時呈紫色、黃色、茶色等，經輻照微量元素形成不同類型的色心，產生不同的顏色，如紫色、黃色、茶色、粉色等。
硬度不同
碧璽的硬度高於水晶，碧璽無解理、高硬度爲特徵，硬度爲7～8，斷口呈球面三角形，密度爲3.06(+0.20，-0.60)克/立方厘米。而水晶的硬度爲7，斷口爲貝殼狀，常呈六棱柱狀，是六方柱和菱面體的聚形，密度爲2.65克/立方厘米。
此外，碧璽的磁場是同色系水晶的幾十倍至上百倍，在珠寶界裏屬於中寶石，優質的碧璽甚至比鑽石還要稀少，而水晶只是一般的寶石而已。