他們之間的區別就是，玉髓是介於翡翠和瑪瑙之間的一種寶石，它不是水晶。玉髓色澤柔和溫潤，可以調節一個人的心境，幫助主人平心靜氣，對人體的視覺系統有很好的調節作用，同時具備聚財的功能，呵呵，玉髓包括藍玉髓、紫玉髓、粉玉髓、白玉髓、紅玉髓等。
玉髓是一種礦物，又名“石髓” ，玉髓其實是一種石英，SiO₂的隱晶質體的統稱，它是石英(隱晶質)的變種。它以乳房狀或鍾乳狀產出，常呈腎狀、鍾乳狀、葡萄狀等，具有蠟質光。玉髓形成於低溫和低壓條件下，出現在噴出巖的空洞、熱液脈、溫泉沉積物、碎屑沉積物及風化殼中。有的玉髓結核內會含有水和氣泡，非常有趣。它的物理性質與石英一樣。玉髓被人們當作寶石，主要用作首飾和工藝美術品的材料。玉髓與人們熟知的瑪瑙是同種礦物。有條帶狀構造的隱晶質石英就是瑪瑙，沒有條帶狀構造、顏色均一的隱晶質石英就是玉髓。
水晶(rock crystal)，稀有礦物，寶石的一種，石英結晶體，在礦物學上屬於石英族，主要化學成份是二氧化硅，化學式爲SiO2，純淨時形成無色透明的晶體，當含微量元素Al、Fe等時呈紫色、黃色、茶色等，經輻照微量元素形成不同類型的色心，產生不同的顏色，如紫色、黃色、茶色、粉色等。含伴生包裹體礦物的被稱之爲包裹體水晶，如發晶、綠幽靈等，內包物爲金紅石、電氣石、陽起石、雲母、綠泥石等。